Publicaciones Especiales
Ha editado cincuenta y un obras que forman la Serie de Publicaciones Especiales, como la Historia Natural del Reino de Guatemala de Fray Francisco Ximénez; Guía de Antigua Guatemala, de J. Joaquín Pardo, Pedro Zamora Castellanos y Luis Luján Muñoz; Justo Rufino Barrios: Una biografía de Paul Burguess; Apuntamientos para la historia de Guatemala y Mis Memorias, de Francisco Lainfiesta; Las artes y las ideas de arte durante la independencia (1794-1821) de Ricardo Toledo Palomo, Crónicas indígenas de Guatemala de don Adrián Recinos,
Aspectos socioeconómicos del traslado de la ciudad de Guatemala 1773-1783 de Cristina Zilbermann de Luján, Ensayos sobre historia del arte en Guatemala y México de Heinrich Berlín, Antología de Antonio José de Irisarri, de John Browning, El Memorial de Sololá y los inicios de la colonización española en Guatemala, de J. Daniel Contreras R. y Jorge Luján Muñoz, Puak: historia económica de Guatemala e Historia de Villa Nueva, ambas de Ernesto Chinchilla Aguilar,
El Memorial de Sololá y los inicios de la colonización española en Guatemala, de J. Daniel Contreras R. y Jorge Luján Muñoz, La tragedia de la Embajada de España en Guatemala, 31 de enero de 1980. Perspectivas, controversias y comentarios, de Jorge Luján Muñoz
Los Negritos de Rabinal y el Juego del Tun, de Carroll E. Mace.
Los poqomames de Petapa durante la Colonia, de Jorge Luján Muñoz. Se reúnen en este libro seis ensayos, debidamente revisados, actualizados y uniformados, todos acerca de Petapa y su área más inmediata durante la época colonial, salvo uno que se refiere a toda la región poqomam. Fueron publicados en diversas revistas y libros entre 1975 y 1993. Al final hay un epílogo, que hace de conclusión, en el que se recogen aspectos adicionales de finales de la Colonia, de cómo un poblado (San Miguel Petapa) se transformó en tres: Petapa, Villa Nueva y Villa Canales. En el apéndice documental se reproducen varios nombramientos de los indios gobernadores de San Miguel, así como una «cuenta y tasación de indios tributarios» de dicho pueblo, en 1562. Se incluyen varios mapas, lo mismo que un índice alfabético onomástico, geográfico y temático, que facilitan la consulta y la comprensión.
Se trata de una valiosa contribución que permite comprender la evolución de dicha región durante la dominación española, y así entender mejor una zona que fue poqomam, en la cual ya no quedan rastros de la población original, la cual puede verse, aunque parcialmente, en los municipios de Mixco y Chinautla, e incluso en Palín.
Notas, recuerdos y memorias, de José Eulalio Samayoa.
Entre cerros, cafetales y urbanismo en el Valle de Guatemala. Proyecto de Rescate Naranjo, de Bárbara Arroyo.
La familia González Lobos Stenhouse, historia de un linaje, de Carlos Alfonso Alvarez-Lobos Villatoro.
Ensayos de historia jurídica y del notariado en Guatemala, de Jorge Luján Muñoz. Se han reunido catorce artículos sobre la historia del derecho en nuestro país, tanto de la época colonial como del siglo XIX. Fueron publicados entre 1980 y 2001, en revistas y obras de diversos países (Alemania, Costa Rica, España, Guatemala, México y Portugal); la mayoría fueron trabajos presentados en congresos o encuentros académicos, en cuyas actas aparecieron originalmente.
La política de lugares y comunidades en la antigua sociedad maya de Petexbatun. Las investigaciones del proyecto arqueológico Aguateca segunda fase, Takeshi Inomata, Daniela Triadan, Erick Ponciano y Kazuo Aoyama, Editores.
Los túmulos funerarios en Guatemala, de Heinrich Berlin y Jorge Luján Muñoz. Segunda edición, 2012.
La Orden Carmelitas Descalzas en Guatemala. Fundación, funcionamiento, ritos y extinción, de René Johnston Aguilar, 2015.
Cuaderno del Cabildo bajo el capitán don Juan de Rubayo Morante, alcalde ordinario de la ciudad y corregidor de los pueblos del valle Guatemala, 1717, Trans. Ernesto Chinchilla Aguilar. Introd. Rosa Helena Chinchilla Mazariegos. Publicación Especial No. 52, 2019
